Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIML1Q8N9V2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIML1Q8N9V2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms