Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD42Q8N9B4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms