Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CLDN19Q8N6F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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