Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms