Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC43Q8N309 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC43Q8N309 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC43Q8N309 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC43Q8N309 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC43Q8N309 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC43Q8N309 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms