Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML4Q8N228 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML4Q8N228 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms