Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms