Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP4Q86YS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
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