Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PALB2Q86YC2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms