Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms