Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHSY1Q86X52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms