Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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