Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms