Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP1Q7RTM1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms