Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms