Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549LQ6ZVL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549LQ6ZVL6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms