Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD109Q6YHK3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CD109Q6YHK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD109Q6YHK3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms