Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL4Q6XD76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL4Q6XD76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms