Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7IPQ6VMQ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms