Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms