Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms