Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARM1Q6SZW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARM1Q6SZW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms