Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms