Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms