Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1BQ6P3S1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms