Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms