Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms