Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.4 ms