Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms