Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms