Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA3Q6AZY7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms