Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD16Q68DU8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms