Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms