Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALRD1Q5VYJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MALRD1Q5VYJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms