Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms