Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF4Q5VUM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms