Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR78Q5VTH9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms