Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDSS1Q5T2R2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDSS1Q5T2R2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms