Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NHSL1Q5SYE7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms