Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VARS2Q5ST30 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VARS2Q5ST30 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms