Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIN3Q5JUX0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIN3Q5JUX0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIN3Q5JUX0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms