Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD3Q5JSP0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms