Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms