Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms