Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms