Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms