Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00303Q3SY05 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms