Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF3Q3KNV8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF3Q3KNV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms