Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM71Q2Q1W2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM71Q2Q1W2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM71Q2Q1W2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms