Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSDQ2M296 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFSDQ2M296 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms